貴社で開設されたGoogle Merchant Centerを削除する必要はありません。
前提としてショッピング広告や無料リスティングの掲載時は
下記2点の紐づけが必須となります。
Google Merchant Center
サイト
そのため、EC Boosterのご利用時は、
EC Booster側で下記2つのアカウントを紐づける設定を行います。
EC BoosterのGoogle Merchant Center
貴社サイト
もし仮に貴社側で下記2点をすでに紐づけていた場合も、
前述した設定によって貴社サイト側の紐付けは自動的に解除され、
EC BoosterのGoogle Merchant Centerからショッピング広告や無料リスティングが
配信される形になりますのでご安心ください。
貴社のGoogle Merchant Center
貴社サイト